Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZ81

Lrrtm3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm3Q8BZ81 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrtm3Q8BZ81 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrtm3Q8BZ81 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrtm3Q8BZ81 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrtm3Q8BZ81 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrtm3Q8BZ81 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrtm3Q8BZ81 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrtm3Q8BZ81 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms