Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abraxas1Q8BPZ8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abraxas1Q8BPZ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abraxas1Q8BPZ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abraxas1Q8BPZ8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms