Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tspan12Q8BKT6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tspan12Q8BKT6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tspan12Q8BKT6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms