Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
D130040H23RikQ8BII3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
D130040H23RikQ8BII3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms