Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trmt12Q8BG71 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trmt12Q8BG71 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trmt12Q8BG71 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt12Q8BG71 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms