Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sptlc3Q8BG54 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sptlc3Q8BG54 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sptlc3Q8BG54 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sptlc3Q8BG54 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sptlc3Q8BG54 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms