Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpped1Q8BFS6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpped1Q8BFS6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpped1Q8BFS6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpped1Q8BFS6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpped1Q8BFS6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Cpped1Q8BFS6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpped1Q8BFS6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms