Protein–RNA interactions for Protein: Q80YT3

Cct8l1, Chaperonin-containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8l1Q80YT3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cct8l1Q80YT3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cct8l1Q80YT3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cct8l1Q80YT3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cct8l1Q80YT3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cct8l1Q80YT3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cct8l1Q80YT3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cct8l1Q80YT3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cct8l1Q80YT3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cct8l1Q80YT3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cct8l1Q80YT3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cct8l1Q80YT3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cct8l1Q80YT3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cct8l1Q80YT3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cct8l1Q80YT3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cct8l1Q80YT3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms