Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcsk9Q80W65 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcsk9Q80W65 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcsk9Q80W65 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcsk9Q80W65 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcsk9Q80W65 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms