Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr2eQ80UW8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2eQ80UW8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2eQ80UW8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Polr2eQ80UW8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2eQ80UW8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms