Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccp110Q7TSH4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccp110Q7TSH4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccp110Q7TSH4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccp110Q7TSH4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms