Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB8

Cyfip1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip1Q7TMB8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyfip1Q7TMB8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyfip1Q7TMB8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyfip1Q7TMB8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyfip1Q7TMB8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms