Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnip4Q6PHZ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnip4Q6PHZ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip4Q6PHZ8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip4Q6PHZ8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms