Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl3Q6P1Y1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl3Q6P1Y1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtl3Q6P1Y1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtl3Q6P1Y1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms