Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pprc1Q6NZN1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pprc1Q6NZN1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Pprc1Q6NZN1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Pprc1Q6NZN1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Pprc1Q6NZN1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pprc1Q6NZN1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pprc1Q6NZN1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pprc1Q6NZN1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pprc1Q6NZN1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pprc1Q6NZN1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pprc1Q6NZN1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pprc1Q6NZN1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pprc1Q6NZN1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pprc1Q6NZN1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pprc1Q6NZN1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pprc1Q6NZN1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pprc1Q6NZN1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pprc1Q6NZN1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pprc1Q6NZN1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pprc1Q6NZN1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pprc1Q6NZN1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pprc1Q6NZN1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Pprc1Q6NZN1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Pprc1Q6NZN1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Pprc1Q6NZN1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms