Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Rprd2Q6NXI6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rprd2Q6NXI6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rprd2Q6NXI6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Rprd2Q6NXI6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rprd2Q6NXI6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rprd2Q6NXI6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms