Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bfsp2Q6NVD9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Bfsp2Q6NVD9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bfsp2Q6NVD9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bfsp2Q6NVD9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms