Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pram1Q6BCL1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pram1Q6BCL1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pram1Q6BCL1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pram1Q6BCL1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pram1Q6BCL1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pram1Q6BCL1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pram1Q6BCL1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pram1Q6BCL1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pram1Q6BCL1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pram1Q6BCL1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pram1Q6BCL1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms