Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2kQ63871 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2kQ63871 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms