Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CochQ62507 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CochQ62507 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CochQ62507 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CochQ62507 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CochQ62507 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CochQ62507 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CochQ62507 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CochQ62507 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CochQ62507 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CochQ62507 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CochQ62507 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CochQ62507 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CochQ62507 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CochQ62507 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CochQ62507 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CochQ62507 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CochQ62507 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CochQ62507 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CochQ62507 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CochQ62507 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CochQ62507 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CochQ62507 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CochQ62507 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CochQ62507 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CochQ62507 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CochQ62507 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CochQ62507 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CochQ62507 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CochQ62507 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CochQ62507 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CochQ62507 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CochQ62507 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CochQ62507 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CochQ62507 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CochQ62507 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CochQ62507 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CochQ62507 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CochQ62507 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CochQ62507 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CochQ62507 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CochQ62507 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CochQ62507 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CochQ62507 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CochQ62507 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CochQ62507 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CochQ62507 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CochQ62507 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CochQ62507 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CochQ62507 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CochQ62507 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CochQ62507 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CochQ62507 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CochQ62507 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CochQ62507 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CochQ62507 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CochQ62507 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CochQ62507 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CochQ62507 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CochQ62507 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CochQ62507 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CochQ62507 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CochQ62507 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CochQ62507 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CochQ62507 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CochQ62507 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CochQ62507 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CochQ62507 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CochQ62507 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CochQ62507 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CochQ62507 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CochQ62507 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CochQ62507 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CochQ62507 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CochQ62507 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CochQ62507 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CochQ62507 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CochQ62507 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CochQ62507 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CochQ62507 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CochQ62507 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CochQ62507 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CochQ62507 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CochQ62507 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CochQ62507 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CochQ62507 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CochQ62507 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CochQ62507 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CochQ62507 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CochQ62507 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CochQ62507 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CochQ62507 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CochQ62507 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CochQ62507 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CochQ62507 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CochQ62507 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CochQ62507 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CochQ62507 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CochQ62507 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CochQ62507 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.9 ms