Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vat1Q62465 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vat1Q62465 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vat1Q62465 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vat1Q62465 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms