Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Phox2aQ62066 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phox2aQ62066 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phox2aQ62066 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms