Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctr9Q62018 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ctr9Q62018 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctr9Q62018 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ctr9Q62018 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctr9Q62018 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms