Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Znf235Q61116 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Znf235Q61116 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Znf235Q61116 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf235Q61116 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms