Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sim1Q61045 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sim1Q61045 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sim1Q61045 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sim1Q61045 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sim1Q61045 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sim1Q61045 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms