Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbbp4Q60972 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbbp4Q60972 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rbbp4Q60972 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rbbp4Q60972 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms