Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DbpQ60925 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DbpQ60925 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DbpQ60925 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DbpQ60925 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DbpQ60925 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DbpQ60925 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DbpQ60925 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DbpQ60925 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DbpQ60925 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DbpQ60925 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.5 ms