Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stxbp3Q60770 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stxbp3Q60770 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stxbp3Q60770 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stxbp3Q60770 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stxbp3Q60770 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9595.6 ms