Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cdcp1Q5U462 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdcp1Q5U462 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdcp1Q5U462 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms