Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zzef1Q5SSH7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zzef1Q5SSH7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zzef1Q5SSH7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms