Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vmn1r209Q5NC97 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vmn1r209Q5NC97 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vmn1r209Q5NC97 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vmn1r209Q5NC97 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vmn1r209Q5NC97 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vmn1r209Q5NC97 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vmn1r209Q5NC97 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vmn1r209Q5NC97 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vmn1r209Q5NC97 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vmn1r209Q5NC97 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Vmn1r209Q5NC97 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vmn1r209Q5NC97 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vmn1r209Q5NC97 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vmn1r209Q5NC97 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vmn1r209Q5NC97 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vmn1r209Q5NC97 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vmn1r209Q5NC97 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms