Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Eme2Q56A04 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Eme2Q56A04 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Eme2Q56A04 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Eme2Q56A04 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Eme2Q56A04 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms