Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc47Q505F5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc47Q505F5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc47Q505F5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc47Q505F5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms