Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phactr4Q501J7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phactr4Q501J7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phactr4Q501J7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms