Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc160Q3UYG1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc160Q3UYG1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc160Q3UYG1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms