Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chpf2Q3UU43 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chpf2Q3UU43 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chpf2Q3UU43 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Chpf2Q3UU43 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chpf2Q3UU43 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chpf2Q3UU43 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chpf2Q3UU43 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chpf2Q3UU43 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms