Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brd9Q3UQU0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brd9Q3UQU0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brd9Q3UQU0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Brd9Q3UQU0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brd9Q3UQU0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brd9Q3UQU0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brd9Q3UQU0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms