Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Washc4Q3UMB9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Washc4Q3UMB9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Washc4Q3UMB9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Washc4Q3UMB9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms