Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmed8Q3UHI4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmed8Q3UHI4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmed8Q3UHI4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms