Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4N7

Igflr1, IGF-like family receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igflr1Q3U4N7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Igflr1Q3U4N7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Igflr1Q3U4N7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Igflr1Q3U4N7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Igflr1Q3U4N7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Igflr1Q3U4N7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Igflr1Q3U4N7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Igflr1Q3U4N7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Igflr1Q3U4N7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Igflr1Q3U4N7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Igflr1Q3U4N7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Igflr1Q3U4N7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Igflr1Q3U4N7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Igflr1Q3U4N7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Igflr1Q3U4N7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms