Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssbp4Q3U4B1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssbp4Q3U4B1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ssbp4Q3U4B1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ssbp4Q3U4B1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms