Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Serac1Q3U213 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Serac1Q3U213 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Serac1Q3U213 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Serac1Q3U213 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Serac1Q3U213 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms