Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmem35bQ3U0Y2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem35bQ3U0Y2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms