Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rufy4Q3TYX8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rufy4Q3TYX8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rufy4Q3TYX8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rufy4Q3TYX8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rufy4Q3TYX8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms