Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pnpla6Q3TRM4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pnpla6Q3TRM4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pnpla6Q3TRM4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pnpla6Q3TRM4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pnpla6Q3TRM4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pnpla6Q3TRM4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pnpla6Q3TRM4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pnpla6Q3TRM4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Pnpla6Q3TRM4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pnpla6Q3TRM4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.2 ms