Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptcd3Q14C51 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ptcd3Q14C51 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptcd3Q14C51 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptcd3Q14C51 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptcd3Q14C51 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ptcd3Q14C51 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptcd3Q14C51 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptcd3Q14C51 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptcd3Q14C51 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptcd3Q14C51 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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