Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cntnap5cQ0V8T7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cntnap5cQ0V8T7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms