Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfe2Q07279 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfe2Q07279 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfe2Q07279 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms