Protein–RNA interactions for Protein: Q06180

Ptpn2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn2Q06180 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn2Q06180 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn2Q06180 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn2Q06180 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn2Q06180 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn2Q06180 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn2Q06180 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn2Q06180 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn2Q06180 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn2Q06180 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptpn2Q06180 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn2Q06180 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms