Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Col1a2Q01149 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Col1a2Q01149 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Col1a2Q01149 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col1a2Q01149 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Col1a2Q01149 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms